Repository of Research and Investigative Information

Repository of Research and Investigative Information

Ahvaz Jundishapur University of Medical Sciences

جداسازی استرپتوکوک پیوژن از بیماران مبتلا به فارنژیت مراجعه کننده به بیمارستان ابوذر شهر اهواز و تیپ بندی ژن کدکننده پروتئین emm typing) M) در این باکتری در سال ۹۲-۱۳۹۱

ابراهیمی فرد, نسیم (2014) جداسازی استرپتوکوک پیوژن از بیماران مبتلا به فارنژیت مراجعه کننده به بیمارستان ابوذر شهر اهواز و تیپ بندی ژن کدکننده پروتئین emm typing) M) در این باکتری در سال ۹۲-۱۳۹۱. Bachelors thesis, دانشگاه علوم پزشکی و خدمات درمانی، بهداشتی جندی شاپور اهواز,school of medicine

[img]
Preview
Text
m99929.pdf

Download (989kB) | Preview

Abstract

استرپتوكوكوس گروه A (Group A Streptococcus=GAS ) یا استرپتوکوکوس پیوژن، كوكسي گرم مثبتی است كه انسان ميزبان اختصاصي آن بوده و از آنجايي كه مي تواند به عنوان carrier وجود داشته باشد، پاتوژن مهمي محسوب مي شود. این باکتری از عوامل مهم بيماريزاي انسان در سراسر دنيا بوده و مي تواند طیف وسیعی از بيماري ها شامل عفونت هاي ساده و خوش خيم ( گلودرد و زردزخم)، تا بيماريهاي كشنده (سندرم شوك توكسيك و فاسيت نكروز شونده) را ايجاد نمايد که مي توانند حالت اندميك يا اپيدميك پيدا كنند. پروتئین های سطحی استرپتوکوکوس که در ارتباط با محیط هستند نقش مهمی در ارتباطات باکتری-میزبان مانند بیماری زایی و اتصال ایفا می کنند. پروتئين M در استرپتوكوك پيوژن يك پروتئين سطحي با ساختار رشته اي است ،كه توسط ژن emm كد شده و به عنوان یک فاكتور ويرولانس مهم مطرح مي باشد. E تایپینگ، استاندارد طلایی مولکولار تایپینگ است و بر اساس سکانس نوکلئوتیدی ژن emm می باشد.هدف از مطالعه حاضر، بررسی تیپ های emm ایزوله های استرپتوکوک پیوژن از بیماران مورد بررسی با استفاده از تکنیک emm تایپینگ بود. تاکنون ،180 تيپ پروتئین M بوسيله سكانس هاي ژني منحصر بفرد emm شناسائی شده اند. مواد و روش ها: 1000 نمونه گلو از بیماران مبتلا به فارنژیت مراجعه کننده به بیمارستان كودكان ابوذر شهر اهواز در طول مدت 7 ماه (از آذرماه 1391 لغايت خردادماه 1392) جمع آوری شد. از این 1000نمونه، استرپتوکوک پیوژن ها با روش های استاندارد کشت وبیوشیمایی تشخیص داده شدند. برای تعیین حساسیت استرپتوکوک پیوژن ها به آنتی بیوتیک ها، روش دیسک دیفیوژن کربی بائر انجام شد و تکثیر ژن emm بوسیله PCR با استفاده از پرایمرهای استاندارد و پروتوکل مورد نظر انجام شد. نتایج: از کل نمونه های مورد بررسی، 25 ایزوله به عنوان استرپتوکوک پیوژن تشخیص داده شد. تست حساسیت آنتی بیوتیکی نشان داد کل ایزوله های استرپتوکوک پیوژن به پنی سیلین و اریترومایسین حساسیت داشتند در حالیکه 44درصد ایزوله ها به ونکومایسین مقاوم بودند. بر اساس PCR ژن emm تیپ های : emm3 20 (80), emm-1 4 (16), emm-75 1 (4)گزارش شدند. تیپ emm-1 و emm-3 بیشتر در گروه زنان مشاهده شدند و تیپ emm-75 فقط در گروه مردان وجود داشت. نتیجه گیری: عفونت های استرپتوکوکی یکی از مشکلات مهم در مراکز بهداشتی و درمانی می باشند. با توجه به یافته های این مطالعه می توان نتیجه گرفت بیشتر ایزوله ها به پنی سیلین و اریترومایسین حساس بودند، لذا این آنتی بیوتیک ها همچنان بر روی این ارگانیسم موثر می باشند. با توجه به اینکه اکثر بیماران به فارنژیت چرکی مبتلا بودند، به نظر می رسد که تیپ emm-3 با بیماری های تهاجمی از جمله فارنژیت چرکی شدید ارتباط داشته باشد. emm تایپینگ روش مفیدی براي تشخيص تنوع ژنتيكي در ميان ايزوله هاي GASمی باشد.از آنجایی که پروتئین M یک پروتئین چندوظیفه ای است، با روش های مولکولی بیماری زایی Mپروتئین ها، برخورد میزبان-باکتری و تخمین استراتژی های واکسن بهتر صورت می گیرد. Group A Streptococcus (GAS) is a gram-positive cocci that has human as exclusive host. While GAS could exist as a carrier state, it is also an important pathogen responsible for a variety of pathologies, ranging from benign (pharyngitis and impetigo) to lethal invasive diseases (toxic shock syndrome and necrotizing fasciitis). Streptococcus surface proteins play an essential role in host–bacteria relationships such as virulence and/or adherence since they are located at the interface with the environment. The GAS M protein, encoded by the emm gene, which acts as a major virulence factor. emm-typing is the GAS molecular typing gold standard and is based on the DNA sequence of the nucleotides of the emm gene. Currently, more than 180 emm-types have been reported throughout the world. The aim of present study was to isolate GAS from patients and detection of emm types of the isolates by using emm typing. Materials and Methods: In total 1000 throat samples from patients with pharyngitis referred to Aboozar children hospital in Ahvaz, were collected during a 7-month period. The samples were processed and the detection and identification of isolates as Streptococcus pyogenes were done by standard culture method and biochemical tests. For susceptibility testing of GAS strains to tested antibiotics, the Kirby-Bauer disk diffusion method were used. Amplification of the emm gene was performed by PCR using the standard primers and described protocol. Results: From total throat samples screened, 25 isolates were identified as Streptococcus pyogenes. Antibiotic susceptibility testing revealed that all the GAS isolates, were susceptible to penicillin and erythromycin, but 44% of isolates showed resistance to vancomycin. Based on PCR for emm gene, the obtained emm types were: emm-3, observed in 20 isolates (80%), emm-1 observed in 4 isolates (16%), and emm-75 observed in one isolate (4%). emm-1 and emm-3 types were observed in female group, while emm-75 was detected in male group only. Conclusion: Streptococcal infections are a major problem in health centers. Sequencing of the variable region of the emm gene of GAS isolates (emm typing) is effective for surveying the sequence variability of the M virulence protein, and is useful for monitoring GAS strain diversity

Item Type: Thesis (Bachelors)
Keywords: استرپتوکوکوس پیوژن، emm تایپینگ، مقاومت آنتی بیوتیکی Antibiotic Resistance emm، Streptococcus pyogenes
Subjects: Q Science > QR Microbiology
R Medicine > RF Otorhinolaryngology
Divisions: Faculty of Medicine, Health and Life Sciences > School of Medicine
Depositing User: آقای بهرام سوسنی غریب وند
Date Deposited: 08 Jan 2018 09:03
Last Modified: 08 Jan 2018 09:03
URI: http://eprints.ajums.ac.ir/id/eprint/11401

Actions (login required)

View Item View Item