Repository of Research and Investigative Information

Repository of Research and Investigative Information

Ahvaz Jundishapur University of Medical Sciences

بررسی میزان موتاسیون در ژن های embCAB در ایزوله های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مقاوم به اتامبوتول در مرکز رفرنس سل اهواز، سال1395 The relative frequency of ethambutol resistance in Mycobacterium tuberculosis isolates from Ahvaz and characterization of embCAB gene mutations associated with ethambutol resistance, year 2016.

عبدی, مهتاب (2018) بررسی میزان موتاسیون در ژن های embCAB در ایزوله های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مقاوم به اتامبوتول در مرکز رفرنس سل اهواز، سال1395 The relative frequency of ethambutol resistance in Mycobacterium tuberculosis isolates from Ahvaz and characterization of embCAB gene mutations associated with ethambutol resistance, year 2016. Masters thesis, Ahvaz Jundishapur University of Medical Sciences, Ahvaz, Iran,School of Medicine دانشکده پزشکی

[img]
Preview
Text
m129569.pdf

Download (824kB) | Preview

Abstract

مقدمه: سل یکی از قدیمی ترین بیماری های شناخته شده در انسان و یک عامل تهدید کننده سلامت می باشد. تخمین زده شده که 3/1 مردم جهان به باکتری مایکوباکتریوم توبرکلوزیس آلوده شده اند. اتامبوتول یکی از دارو های خط اول در ترکیب استاندارد درمان سل می باشد. با افزایش سریع مقاومت اتامبوتول در بین سویه های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس، تشخیص زود هنگام مقاومت به اتامبوتول بسیار کارامد می باشد. با توجه به این که اپرون embCAB در مقاومت به اتامبوتول درگیر می شود، این مطالعه با هدف آنالیز موتاسیون های این اپرون در بین ایزوله های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس در شهر اهواز به منظور تعیین ارتباط احتمالی بین این موتاسیون ها و مقاومت به اتامبوتول انجام شد. مواد و روش ها: در مجموع 307 ایزوله بالینی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس جهت بررسی مقاومت اتامبوتول، براساس تست حساسیت دارویی پروپورشنال انجام گردید. PCR بر روی DNA استخراج شده از همه سویه های بالینی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مقاوم به اتامبوتول و تعدادی سویه حساس به اتامبوتول که به صورت تصادفی انتخاب شده بودند، با استفاده از مجموعه ای از پرایمرها برای ژن های embC، embAو embB انجام گردید، سپس تعیین توالی برای تشخیص شایع ترین تغییرات انجام شد. نتایج: در مجموع 10(25/3%) سویه با روش تست حساست دارویی، مقاومت به اتامبوتول را نشان دادند. میزان موتاسیون در 10 سویه مقاوم به اتامبوتول، 20%(2n=) بود، که یک موتاسیون در ژنembB(10%) در کدون 306(متیونین به والین) و یک موتاسیون هم در ژن embCدر کدون270(تیروزین به ایزولوسین) مشاهده شد. همچنین یک موتاسیون بی معنی در ژن embA در یکی از سویه های حساس که به صورت تصادفی انتخاب شده بودند مشاهده شد. نتیجه گیری:اکثر سویه های مقاوم به اتامبوتول(8/8n=) با موتاسیون در اپرون embCAB توضیح داده نمی شوند، بنابراین این موتاسیون ها به تنهایی برای توسعه مقاومت کامل به اتامبوتول در سویه های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس کافی نیستند و مکانیسم های دیگر مقاومت غیر از موتاسیون در اپرون embCAB باید در نظر گرفته شود. Introduction: Tuberculosis (TB), one of the oldest diseases known to humans, remains a major public health threat. It is estimated that one-third of the world's population are infected with the causative agent, Mycobacterium tuberculosis. Ethambutol (EMB) is one of the first line drugs in the standard combination therapy for tuberculosis (TB), however, due to the rapid increase in EMB resistance among clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis (MTB), early detection of EMB resistance is desirable. As the embCAB operon is considered to be involved in resistance to EMB, this study was aimed to analyze the mutations within embCAB operon among MTB isolates from Iran, to find out a possible association between these mutations and EMB resistance. Material and Methods:A total of 307 clinical isolates of MTB were screened for EMB resistance by phenotypic drug susceptibility testing. PCR amplification was performed on extracted DNA from all EMB-resistant and randomly selected EMB-susceptible isolates by using sets of primers for various gene loci of embC, embA and emb, followed by sequencing for the detection of most common alterations. Results: In total 10 isolates showed resistance to EMB by phenotypic susceptibility testing (3.25 %). The mutation rate in 10 EMB-resistant MTB strains was 20.0% (n=2), comprises one mutation in embB (10.0%), at codon 306 Met to Val, and one in embC (10.0%), at codon 270 Thr to Ile. A non-synonymous mutation in embA gene in one of the randomly selected EMB susceptible isolates located in codon 330 Lue to Lue were also noticed Conclusions:The majority of our EMB-resistant isolates (n=8/ 80%) could not be explained by the mutations within embCAB. So, these mutations alone, are not sufficient for the development of full resistance to EMB in MTB isolates. Additional mechanisms of resistance other than mutations within embCAB operon should also be considered.

Item Type: Thesis (Masters)
Subjects: Q Science > QR Microbiology
Divisions: Faculty of Medicine, Health and Life Sciences > School of Medicine
Depositing User: آقای بهرام سوسنی غریب وند
Date Deposited: 04 Sep 2018 03:58
Last Modified: 04 Sep 2018 03:58
URI: http://eprints.ajums.ac.ir/id/eprint/20231

Actions (login required)

View Item View Item