Repository of Research and Investigative Information

Repository of Research and Investigative Information

Ahvaz Jundishapur University of Medical Sciences

تعیین پروفایل ویرولانس و مکانیزم ملکولی مقاومت به کلاریترومایسین و مترونی داز و لدرسویه های هلیکوباکترپیلوری جداشده از بیماران مبتلا به مشکلات گوارشی شهر اهواز با استفاده ازروشMultiplex PCRوPCR-RFLP Determination of virulence profile and molecular mechanism of Clarithromycin & Metronidazole resistance in Helicobacter pylori strains isolated from gastric patients of Ahwaz city by Multiplex PCR & PCR-RFLP

سراجیان, امیر ارسلان (2018) تعیین پروفایل ویرولانس و مکانیزم ملکولی مقاومت به کلاریترومایسین و مترونی داز و لدرسویه های هلیکوباکترپیلوری جداشده از بیماران مبتلا به مشکلات گوارشی شهر اهواز با استفاده ازروشMultiplex PCRوPCR-RFLP Determination of virulence profile and molecular mechanism of Clarithromycin & Metronidazole resistance in Helicobacter pylori strains isolated from gastric patients of Ahwaz city by Multiplex PCR & PCR-RFLP. PhD thesis, Ahvaz Jundishapur University of Medical Sciences, Ahvaz, Iran,School of Medicine دانشکده پزشکی

[img]
Preview
Text
m129961.pdf

Download (1MB) | Preview

Abstract

عنوان پایان‌نامه: تعیین پروفایل ویرولانس و مکانیسممولکولی مقاومت به کلاریترومایسین ومترونیدازول در سویه‌هایهلیکوباکترپیلوری جداشده از بیماران مبتلابه مشکلات گوارشی شهر اهواز با استفاده از روشMultiplex PCR و PCR-RFLP مقدمه:هلیکوباکترپیلوریباکتریگرممنفیاسپیرالشکلبودهکهنیمیازجمعیتجهانراآلودهکردهوعاملاصلیگاستریتمزمن،زخممعدهوبدخیمی‌هایمعدهاست.عواملیکهسبببروزبیماری‌هایناشیازسویه‌هایهلیکوباکترپیلوریگردیده شاملحساسیتمیزبان،عواملمحیطیوعواملبیماری‌زایباکتریمی‌باشند.تنوعژنتیکیزیادیدرجمعیتباکتریوجوددارد. اینتنوعژنتیکیمنجربهگوناگونیدرخصوصیاتباکتریمثلمقاومتبهآنتی‌بیوتیک،اتصالبهسلول‌هایاپیتلیالوتولیدتوکسینمی‌گردد.باکتریبه‌سرعتبهبسیاریازآنتی‌بیوتیک‌هامقاوممی‌گرددکهاینامرمنجربهعدمحذفکاملباکتریوبازگشتبیماریاست. روش کار: جهت 131 سویه هلیکوباکترپیلوری ایزوله شده، ژن‌های ویرولانس دسته‌بندی و با روش PCR چندگانه شیوع این ژن‌ها تعیین و همچنین مقاومت دارویی سویه‌ها با استفاده از روش E.test و PCR-RFLP بررسی و میزان مقاومت سویه‌ها به آنتی‌بیوتیک‌هایموردبررسی تعیینگردید. ارتباط بین ژن‌های ویرولانس و مقاومت سویه‌ها با سن، جنس و قومیت بیماران نیز بررسی گردید. نتایج:شیوع ژن‌های ureA،cagA،vacA، sodB،hsp60، iceA،iceA1، iceA2،babA،babA2،vacAs1a،vacAs1b، vacAs1c،vacAs2،vacAm1a،vacAm1b،vacAm1c،vacAm2،vacAi1،vacAi2،vacAd1،vacAd2 به ترتیب 100%،74%،100%،4/92%،2/96%،71%،42%،4/37%،74%،8/45%،4/63%،3/5%،7/26%،6/4%،4/34%،0/3%،9/6%،7/55%،9/35%،1/64%،45% و 55%تعیین گردید.بین برخی از عوامل ویرولانس با خصوصیات فردی بیماران و فرم بیماری ارتباط معنی‌دار یافت گردید.میزان مقاومت به کلاریترومایسین، مترونیدازول،سیپروفلوکساسین،تتراسیکلین و آموکسی سیلین به ترتیب4/53%،4/63%،1/19%،3/5% و 7/13% تعیین گردید.شایع‌ترین نوع موتاسیون مسئول مقاومت به کلاریترومایسین A2143G مشخص گردید. نتیجه‌گیری:شیوعژن‌های ویرولانس در سویه‌های تحقیق با بعضی مطالعات متفاوت و با بعضی دیگر تطابق داشت.بین شیوع برخی از ژن‌ها و فرم‌های بیماری ارتباط وجود داشت.میزان مقاومت سویه‌ها به آنتی‌بیوتیک‌هابه‌جز تتراسیکلین بسیار بالا بوده که محل نگرانی و توجه جدی است.عنوان پایان‌نامه: تعیین پروفایل ویرولانس و مکانیسممولکولی مقاومت به کلاریترومایسین ومترونیدازول در سویه‌هایهلیکوباکترپیلوری جداشده از بیماران مبتلابه مشکلات گوارشی شهر اهواز با استفاده از روشMultiplex PCR و PCR-RFLP مقدمه:هلیکوباکترپیلوریباکتریگرممنفیاسپیرالشکلبودهکهنیمیازجمعیتجهانراآلودهکردهوعاملاصلیگاستریتمزمن،زخممعدهوبدخیمی‌هایمعدهاست.عواملیکهسبببروزبیماری‌هایناشیازسویه‌هایهلیکوباکترپیلوریگردیده شاملحساسیتمیزبان،عواملمحیطیوعواملبیماری‌زایباکتریمی‌باشند.تنوعژنتیکیزیادیدرجمعیتباکتریوجوددارد. اینتنوعژنتیکیمنجربهگوناگونیدرخصوصیاتباکتریمثلمقاومتبهآنتی‌بیوتیک،اتصالبهسلول‌هایاپیتلیالوتولیدتوکسینمی‌گردد.باکتریبه‌سرعتبهبسیاریازآنتی‌بیوتیک‌هامقاوممی‌گرددکهاینامرمنجربهعدمحذفکاملباکتریوبازگشتبیماریاست. روش کار: جهت 131 سویه هلیکوباکترپیلوری ایزوله شده، ژن‌های ویرولانس دسته‌بندی و با روش PCR چندگانه شیوع این ژن‌ها تعیین و همچنین مقاومت دارویی سویه‌ها با استفاده از روش E.test و PCR-RFLP بررسی و میزان مقاومت سویه‌ها به آنتی‌بیوتیک‌هایموردبررسی تعیینگردید. ارتباط بین ژن‌های ویرولانس و مقاومت سویه‌ها با سن، جنس و قومیت بیماران نیز بررسی گردید. نتایج:شیوع ژن‌های ureA،cagA،vacA، sodB،hsp60، iceA،iceA1، iceA2،babA،babA2،vacAs1a،vacAs1b، vacAs1c،vacAs2،vacAm1a،vacAm1b،vacAm1c،vacAm2،vacAi1،vacAi2،vacAd1،vacAd2 به ترتیب 100%،74%،100%،4/92%،2/96%،71%،42%،4/37%،74%،8/45%،4/63%،3/5%،7/26%،6/4%،4/34%،0/3%،9/6%،7/55%،9/35%،1/64%،45% و 55%تعیین گردید.بین برخی از عوامل ویرولانس با خصوصیات فردی بیماران و فرم بیماری ارتباط معنی‌دار یافت گردید.میزان مقاومت به کلاریترومایسین، مترونیدازول،سیپروفلوکساسین،تتراسیکلین و آموکسی سیلین به ترتیب4/53%،4/63%،1/19%،3/5% و 7/13% تعیین گردید.شایع‌ترین نوع موتاسیون مسئول مقاومت به کلاریترومایسین A2143G مشخص گردید. نتیجه‌گیری:شیوعژن‌های ویرولانس در سویه‌های تحقیق با بعضی مطالعات متفاوت و با بعضی دیگر تطابق داشت.بین شیوع برخی از ژن‌ها و فرم‌های بیماری ارتباط وجود داشت.میزان مقاومت سویه‌ها به آنتی‌بیوتیک‌هابه‌جز تتراسیکلین بسیار بالا بوده که محل نگرانی و توجه جدی است.عنوان پایان‌نامه: تعیین پروفایل ویرولانس و مکانیسممولکولی مقاومت به کلاریترومایسین ومترونیدازول در سویه‌هایهلیکوباکترپیلوری جداشده از بیماران مبتلابه مشکلات گوارشی شهر اهواز با استفاده از روشMultiplex PCR و PCR-RFLP مقدمه:هلیکوباکترپیلوریباکتریگرممنفیاسپیرالشکلبودهکهنیمیازجمعیتجهانراآلودهکردهوعاملاصلیگاستریتمزمن،زخممعدهوبدخیمی‌هایمعدهاست.عواملیکهسبببروزبیماری‌هایناشیازسویه‌هایهلیکوباکترپیلوریگردیده شاملحساسیتمیزبان،عواملمحیطیوعواملبیماری‌زایباکتریمی‌باشند.تنوعژنتیکیزیادیدرجمعیتباکتریوجوددارد. اینتنوعژنتیکیمنجربهگوناگونیدرخصوصیاتباکتریمثلمقاومتبهآنتی‌بیوتیک،اتصالبهسلول‌هایاپیتلیالوتولیدتوکسینمی‌گردد.باکتریبه‌سرعتبهبسیاریازآنتی‌بیوتیک‌هامقاوممی‌گرددکهاینامرمنجربهعدمحذفکاملباکتریوبازگشتبیماریاست. روش کار: جهت 131 سویه هلیکوباکترپیلوری ایزوله شده، ژن‌های ویرولانس دسته‌بندی و با روش PCR چندگانه شیوع این ژن‌ها تعیین و همچنین مقاومت دارویی سویه‌ها با استفاده از روش E.test و PCR-RFLP بررسی و میزان مقاومت سویه‌ها به آنتی‌بیوتیک‌هایموردبررسی تعیینگردید. ارتباط بین ژن‌های ویرولانس و مقاومت سویه‌ها با سن، جنس و قومیت بیماران نیز بررسی گردید. نتایج:شیوع ژن‌های ureA،cagA،vacA، sodB،hsp60، iceA،iceA1، iceA2،babA،babA2،vacAs1a،vacAs1b، vacAs1c،vacAs2،vacAm1a،vacAm1b،vacAm1c،vacAm2،vacAi1،vacAi2،vacAd1،vacAd2 به ترتیب 100%،74%،100%،4/92%،2/96%،71%،42%،4/37%،74%،8/45%،4/63%،3/5%،7/26%،6/4%،4/34%،0/3%،9/6%،7/55%،9/35%،1/64%،45% و 55%تعیین گردید.بین برخی از عوامل ویرولانس با خصوصیات فردی بیماران و فرم بیماری ارتباط معنی‌دار یافت گردید.میزان مقاومت به کلاریترومایسین، مترونیدازول،سیپروفلوکساسین،تتراسیکلین و آموکسی سیلین به ترتیب4/53%،4/63%،1/19%،3/5% و 7/13% تعیین گردید.شایع‌ترین نوع موتاسیون مسئول مقاومت به کلاریترومایسین A2143G مشخص گردید. نتیجه‌گیری:شیوعژن‌های ویرولانس در سویه‌های تحقیق با بعضی مطالعات متفاوت و با بعضی دیگر تطابق داشت.بین شیوع برخی از ژن‌ها و فرم‌های بیماری ارتباط وجود داشت.میزان مقاومت سویه‌ها به آنتی‌بیوتیک‌هابه‌جز تتراسیکلین بسیار بالا بوده که محل نگرانی و توجه جدی است.عنوان پایان‌نامه: تعیین پروفایل ویرولانس و مکانیسممولکولی مقاومت به کلاریترومایسین ومترونیدازول در سویه‌هایهلیکوباکترپیلوری جداشده از بیماران مبتلابه مشکلات گوارشی شهر اهواز با استفاده از روشMultiplex PCR و PCR-RFLP مقدمه:هلیکوباکترپیلوریباکتریگرممنفیاسپیرالشکلبودهکهنیمیازجمعیتجهانراآلودهکردهوعاملاصلیگاستریتمزمن،زخممعدهوبدخیمی‌هایمعدهاست.عواملیکهسبببروزبیماری‌هایناشیازسویه‌هایهلیکوباکترپیلوریگردیده شاملحساسیتمیزبان،عواملمحیطیوعواملبیماری‌زایباکتریمی‌باشند.تنوعژنتیکیزیادیدرجمعیتباکتریوجوددارد. اینتنوعژنتیکیمنجربهگوناگونیدرخصوصیاتباکتریمثلمقاومتبهآنتی‌بیوتیک،اتصالبهسلول‌هایاپیتلیالوتولیدتوکسینمی‌گردد.باکتریبه‌سرعتبهبسیاریازآنتی‌بیوتیک‌هامقاوممی‌گرددکهاینامرمنجربهعدمحذفکاملباکتریوبازگشتبیماریاست. روش کار: جهت 131 سویه هلیکوباکترپیلوری ایزوله شده، ژن‌های ویرولانس دسته‌بندی و با روش PCR چندگانه شیوع این ژن‌ها تعیین و همچنین مقاومت دارویی سویه‌ها با استفاده از روش E.test و PCR-RFLP بررسی و میزان مقاومت سویه‌ها به آنتی‌بیوتیک‌هایموردبررسی تعیینگردید. ارتباط بین ژن‌های ویرولانس و مقاومت سویه‌ها با سن، جنس و قومیت بیماران نیز بررسی گردید. نتایج:شیوع ژن‌های ureA،cagA،vacA، sodB،hsp60، iceA،iceA1، iceA2،babA،babA2،vacAs1a،vacAs1b، vacAs1c،vacAs2،vacAm1a،vacAm1b،vacAm1c،vacAm2،vacAi1،vacAi2،vacAd1،vacAd2 به ترتیب 100%،74%،100%،4/92%،2/96%،71%،42%،4/37%،74%،8/45%،4/63%،3/5%،7/26%،6/4%،4/34%،0/3%،9/6%،7/55%،9/35%،1/64%،45% و 55%تعیین گردید.بین برخی از عوامل ویرولانس با خصوصیات فردی بیماران و فرم بیماری ارتباط معنی‌دار یافت گردید.میزان مقاومت به کلاریترومایسین، مترونیدازول،سیپروفلوکساسین،تتراسیکلین و آموکسی سیلین به ترتیب4/53%،4/63%،1/19%،3/5% و 7/13% تعیین گردید.شایع‌ترین نوع موتاسیون مسئول مقاومت به کلاریترومایسین A2143G مشخص گردید. نتیجه‌گیری:شیوعژن‌های ویرولانس در سویه‌های تحقیق با بعضی مطالعات متفاوت و با بعضی دیگر تطابق داشت.بین شیوع برخی از ژن‌ها و فرم‌های بیماری ارتباط وجود داشت.میزان مقاومت سویه‌ها به آنتی‌بیوتیک‌هابه‌جز تتراسیکلین بسیار بالا بوده که محل نگرانی و توجه جدی است. Title:Determination of virulence profile and molecular mechanism of Clarithromycin & Metronidazole resistance in Helicobacter pylori strains isolated from gastric patients of Ahwaz city by Multiplex PCR & PCR-RFLP Interoduction:Helicobacter pylori is a spiral-shaped gram-negative bacterium that infects half of the world's population and is the main cause of chronic gastritis, gastric ulcer and gastric malignancies.The Factors that cause diseases by Helicobacter pylori strains include host sensitivity, environmental factors, and bacterial virulence factors.There is a lot of genetic diversity in the bacterial population.This genetic diversity leads to a variety of bacterial characteristics Like antibiotic resistance, attachment to epithelial cells, and toxin production.Helicobacter pylori rapidly becomes resistant to many antibiotics after treatment, which leads to incomplete elimination of bacteria and rapid return of disease. Methods: The virulence genes of 131 isolates of Helicobacter pylori were classified and prevalence of these genes determined using multiplex PCR method.The drug resistance of strains was investigated using E.test and PCR-RFLP, and the molecular mechanism of resistance to certain antibiotics were determined.The relationship between virulence genes and resistance of strains with the age, sex and ethnicity of patients was also investigated. Results: prevalence ofureaA, cagA, vacA,sodB, hsp60,iceA,iceA1, iceA2, babA,babA2, vacAs1a, vacAs1b, vacAs1c, vacAs2,vacAm1a, vacAm1b,vacAm1c,vacAm2,vacAi1, vacAi2, vacAd1,vacAd2,geneswere100%،74%،100%،92.4%،96.2%،71%،42%،37.4%،74%،45.8%،63.4%،5.3%،26.7%،4.6%،34.4%،3.0%،6.9%،55.7%،35.9%،64.1%،45%،55% respectively.There was a significant relationship between some of the virulence factors with patient's individual characteristics and the form of the disease. Resistance to clarithromycin, metronidazole, ciprofloxacin, tetracycline and amoxicillin was determined 53.4%, 63.4%, 19.1%, 5.3% and 13.7%, respectively.The most common type of mutation responsible for resistance to clarithromycin was A2143G. Conclusion: The prevalence of virulence genes in the strains of present research was consistent with some studies and opposite to some others.There was a relationship between the prevalence of some genes and disease forms.The strains resistance to antibiotics is very high, with the exception of tetracycline, which is a serious concern.

Item Type: Thesis (PhD)
Subjects: Q Science > QR Microbiology
Divisions: Faculty of Medicine, Health and Life Sciences > School of Medicine
Depositing User: آقای بهرام سوسنی غریب وند
Date Deposited: 11 Sep 2018 06:14
Last Modified: 11 Sep 2018 06:14
URI: http://eprints.ajums.ac.ir/id/eprint/20341

Actions (login required)

View Item View Item