Repository of Research and Investigative Information

Repository of Research and Investigative Information

Ahvaz Jundishapur University of Medical Sciences

تعیین سویه¬های اکینوکوکوس گرانولوزوس در دام¬های کشتار شده شهرستان شوش با روش PCR-RFLP

فلاحی زاده, سمیه (2018) تعیین سویه¬های اکینوکوکوس گرانولوزوس در دام¬های کشتار شده شهرستان شوش با روش PCR-RFLP. Masters thesis, Ahvaz Jundishapur University of Medical Sciences, Ahvaz, Iran,School of Medicine

[img] Text
m131441.pdf

Download (1MB)

Abstract

مقدمه: هیداتیدوز عفونت ناشی از مراحل لاروی اکینوکوکوس گرانولوزوس است که انسان و به ویژه نشخوارکنندگان را به عنوان میزبان واسط درگیر می¬سازد. تا کنون 10 ژنوتایپ از انگل در میزبان¬های مختلف مورد شناسایی قرار گرفته¬اند. از این رو، هدف از مطالعه حاضر، شناسایی سویه¬های کیست هیداتید آلوده کننده حیوانات کشتار شده شهرستان شوش، در جنوب غربی ایران، با روش PCR-RFLP می¬باشد. مواد و روش¬ها: طی این مطالعه مقطعی، تعداد 96 نمونه کیست هیداتید از احشاء دام¬های کشتار شده در کشتارگاه شهرستان شوش شامل 60 راس گوسفند، 13 راس گاو و 11 راس گاومیش و 12 راس بز جمع آوری گردید. پس از تخلیه مایع از کیست¬ها و رسوب گیری پروتواسکولکس¬ها، استخراج DNA و متعاقب آن PCR بر روی ژن rDNA-ITS1 انجام شد. سپس، روش RFLP توسط آنزیم¬های محدود کننده AluI، RsaI، HpaII و TaqI صورت گرفت. همچنین، تعداد 20 نمونه مثبت PCR مورد توالی یابی قرار گرفتند. نتایج: نتایج حاصل شده از روش مولکولی PCR در تمامی ایزوله¬های کیست هیداتید نشانگر باندی با طول 1000 جفت باز بود. آنالیز RFLP نیز بیانگر الگوی هضم آنزیمی مشابه در تمامی نمونه¬ها بود که بیانگر ژنوتایپ G1 است. قطعات ایجاد شده ناشی از هضم با آنزیم AluI 200 و 800 جفت بازی بودند، در حالیکه برش با آنزیم HpaII منجر به تشکیل باند 300 و 700 جفت بازی شد. همچنین مشخص شد که آنزیم RsaI قطعاتی با طول 345 و 655 جفت باز ایجاد می¬کند، اما آنزیم TaqI هیچ گونه برشی را در تمامی ایزوله¬ها ایجاد نکرد. داده¬های حاصل از توالی یابی 20 نمونه کیست هیداتید مشخص نمود که همگی آنها از نوع G1 هستند. نتیجه گیری: این مطالعه نشان داد که سویه غالب اکینوکوکوس گرانولوزوس در شهرستان شوش G1 می باشد. تنوع ژنوتایپ¬های اکینوکوکوس گرانولوزوس، گستره و اختصاصیت میزبان¬های واسط درگیر و اهمیت این بیماری از جنبه بهداشت عمومی همگی تاکید بر اهمیت شناسایی ژنوتایپ¬های کیست هیداتید در سایر جوامع حیوانی و نیز انسانی شهر شوش دارند. Determination of Echinococcus granulosus genotypes in livestock slaughtered in Shush County, Southwest Iran using PCR-RFLP Abstract Background: Hydatidosis is the infection with Echinococcus granulosus metacestode, which affects human and particularly ruminants as the intermediate hosts. Totally, ten genotypes have been identified for hydatid cyst. Thus, we aimed to evaluate the genotypes of isolated cysts from slaughtered animals in Shush county, southwestern Iran, using PCR-RFLP. Methods: In this cross-sectional study, 96 hydatid cysts were isolated from slaughtered animals, comprising 60 sheep, 13 cattle, 12 goat and 11 buffalo. After cyst drainage and protoscolex sedimentation, DNA was extracted and PCR was accomplished on rDNA-ITS1 gene. Further, the RFLP technique was performed using AluI, RsaI, HpaII and TaqI restriction enzymes. Also, 20 PCR-positive samples were submitted for sequencing. Results: Molecular identification of 96 hydatid cysts demonstrated a distinctive 1000 bp fragment in all samples from four animal hosts. RFLP analysis showed similar digestion patterns in all samples representing G1 strain. AluI digestion yielded 800 bp and 200 bp fragments, HpaII digestion made 700 bp and 300 bp fragments and RsaI digestion entailed 655 and 345segments. Moreover, TaqI rendered no digestion pattern on rDNA-ITS1 region. In addition, molecular sequencing disclosed that all 20 hydatid cysts were G1 genotype. Conclusion: This study indicated that G1 is the dominant genotype of Echinococcus granulosus in Shush county, southwest Iran. Variations in the genetic strains of Echinococcus granulosus populations, their host diversity and specificity and public health importance would emphasize the molecular discernment of hydatid cyst genotypes in human and other animal populations of this region.

Item Type: Thesis (Masters)
Keywords: : شیوع، اکینوکوکوس گرانولوزوس، ژنوتایپ G1، PCR-RFLP، شوش، ایران Prevalence, Echinococcus granulosus, G1 genotype, PCR-RFLP, Shush, Iran
Subjects: Q Science > QR Microbiology
R Medicine > RC Internal medicine
Divisions: Faculty of Medicine, Health and Life Sciences > School of Medicine
Depositing User: آقای بهرام سوسنی غریب وند
Date Deposited: 16 Jan 2019 09:13
Last Modified: 16 Jan 2019 09:15
URI: http://eprints.ajums.ac.ir/id/eprint/20703

Actions (login required)

View Item View Item