Repository of Research and Investigative Information

Repository of Research and Investigative Information

Ahvaz Jundishapur University of Medical Sciences

تیپ بندی مولکولی سویه های بالینی پسودوموناس آئروژینوزای دارای ژن های مولد مقاومت پلاسمیدی به کارباپنم ها جدا شده از بیماران بستری در بیمارستان های پنج شهر استان خوزستان با استفاده از تکنیک های الکتروفورز میدان پالسی (PFGE) و تیپ بندی سکانس دو گانه (DLST)

شاهین, مجتبی (2018) تیپ بندی مولکولی سویه های بالینی پسودوموناس آئروژینوزای دارای ژن های مولد مقاومت پلاسمیدی به کارباپنم ها جدا شده از بیماران بستری در بیمارستان های پنج شهر استان خوزستان با استفاده از تکنیک های الکتروفورز میدان پالسی (PFGE) و تیپ بندی سکانس دو گانه (DLST). PhD thesis, Ahvaz Jundishapur University of Medical Sciences, Ahvaz, Iran,School of Medicine

[img] Text
m131593.pdf

Download (1MB)

Abstract

مقدمه یکی از مهمترین مقاومت های آنتی بیوتیکی نوظهور، ژن NDM-1 می باشد. ایزوله کوهاربورینگ با سه یا چهار ژن کارباپنمازی نادر است و تنها چند گزارش در مقالات وجود دارد. در این مطالعه ویژگی های شیوع یک همه گیری بزرگ شرح داده شد و گزارش های تولید NDM-1 را با سایر ژن های کارباپنمازی در جدایه های پسودوموناس آئروژینوزا گزارش گردید. کارباپنم ها معمولا به عنوان داروهای انتخابی برای درمان عفونت های ناشی از چندین مقاومت چند دارویی مورد استفاده قرار می گیرند؛ اما در موارد جداسازیCRPA، کلستین ممکن است به عنوان تنها گزینه برای درمان باشد.. DLST یک روش ژنتیکی برای نظارت و تایپ بندی اپیدمیولوژیک ایزوله های پسودوموناس آئروژینوزا می باشد. هدف این مطالعه بررسی وجود انواع مختلف ژن های کارباپنمازی بود. هدف دوم، تایپ کردن این جدایه ها و سایر ایزوله های دارای ژن های متالوبتالاکتامازی با استفاده از روش DLST بود. روش كار: 369 جدايه پسودوموناس آئروژینوزا در مدت 28 ماه جمع آوري شد. پس از شناسایی، تست حساسیت به آنتی بیوتیک ها با روش انتشار دیسک و روش MIC انجام گردید. تمام جدايه ها با استفاده از MHT براي توليد ژن کارباپنماز آزمايش شدند. کلاس های بتالاکتاماز ژن های A، Bو D با استفاده از PCR تشخیص داده شد. تمام جدایه هایNDM-1 برای تولید فنوتیپی ژن های کارباپنمازی با استفاده از تکنیک DDST و DDPT آزمایش شدند. پس از شناسايي جدايه هايMBL، آنها با روش هاي DLST و PFGE تایپ بندی شدند. نتایج: از میانCRPA 236، 116 جدایه دارای ژن MBL بودند و 29 ایزوله برای NDM-1 مثبت شد. در ایزوله های CRPA، IMP-1، VIM-2 و OXA-10 به ترتیب در 27.5٪، 21.1٪ و 32.2٪ از جدایه ها شناسایی شدند.5 ایزوله (1.3٪) به كوليستين مقاوم بودند. در این جدایه ها NDM-1، IMP-1، VIM-2 و OXA-10 در 40٪، 40٪، 20٪ و 100٪ از این ایزوله ها شناسایی شدند، ژنKPC، GESو SPM در هیچ یک از ایزوله ها شناسایی نشد. کلاستر اصلی DLST و PFGE شامل DLST 25-11 وگروه A بودند. بحث و نتيجه گيري: یافتن این ژن های دارای مقاومت چندگانه به کرباپنم ها یک تهدید برای سلامتی عمومی می باشد. اسید دیپیکولینیک در تکنیک DDPT دارای برتری محسوسی نسبت به EDTA در روش DDST برای تشخیص فنوتیپی ایزوله های MBL می باشد. DLST نوع 25-11 یک کلاستر قابل توجه و خطرناک است، زیرا 45٪ از جدایه های مثبت NDM-1 این ژنوتیپ را نشان دادند. Introduction: NDM-1 is one of the most important emerging antibiotic resistance. Co-harboring three or four carbapenemases is rare and only a few reports exist in the literature. We describe the characteristics of the large epidemic outbreaks and reports co-producing blaNDM-1 with the other carbapenemase genes in P. aeruginosa isolates. Carbapenems are commonly used as choice drugs for the treatment of infections caused by multidrug‑resistant P. aeruginosa (MDRP) isolates; but in CRPA isolates, colistin might be useful as a last‑resort option against infections caused by this pathogens. DLST is a genotyping technique which can be applied for the epidemiological surveillance of Pseudomonas aeruginosa strains. The aim study was to evaluate the existence of encoding different classes of carbapenemase genes. Second aim was to assess the effect of colistin on CRPA strains and typing of this isolates by DLST method Materials and Methods: 369 isolates of P. aeruginosa were collected of Iran. After identification tests, the susceptibility to the antibiotics was done by disk diffusion and MIC methods. All isolates were tested for carbapenemase production using the MHT. Beta-lactamase classes A, B and D genes were detected by PCR. All blaNDM-1 isolates were tested for carbapenemase production using the DDST and DDPT. After identification of MBL isolates, all of them were characterized by DLST and PFGE methods. Results: Among 236 carbapenem-resistant P. aeruginosa (CRPA), 116 isolates have had MBL genes and twenty nine isolates were found positive for blaNDM-1. In CRPA isolates, blaIMP-1, blaVIM-2 and blaOXA-10 were identified in 27.5%, 21.1% and 32.2% of isolates respectively, while co-producing blaNDM-1, blaIMP-1, blaOXA-10, co-producing blaNDM-1, blaVIM-2, blaOXA-10 and co-producing blaIMP-1, blaVIM-2 were determined in 11 (4.6%), 8 (3.4%) and 27 (11.4%) of isolates respectively. Five isolates from the collection (1.3%) were resistant to colistin. In this isolates, blaNDM-1, blaIMP-1, blaVIM-2 and blaOXA-10 were identified in 40%, 40%, 20% and 100% of isolates respectively, while the percentage of co-producing blaNDM-1, blaIMP-1 and blaNDM-1, blaVIM-2 genes were 20% of each. blaKPC, blaGES and blaSPM genes were not detected in colistin-resistant isolates. Conclusion: The main cluster DLST and PFGE were including patients infected or colonized with the genotype of DLST 25-11 and group A respectively. The finding of this co-existence of multiple carbapenemas resistance genes is threating for public health. Dipicolinic acid is a superior MBL inhibitor in DDPT tanique than EDTA in DDST method for the detection of MBL-blaNDM-1 producing P.aeruginosa. DLST type 25-11 is a significant cluster because 45% of blaNDM-1 positive isolates revealed this genotype.

Item Type: Thesis (PhD)
Keywords: پسودوموناس آئروژینوزا، CRPA،MHT ، DDPT،PFGE ، DLST : Pseudomonas aeruginosa, CRPA, MHT, DDPT, PFGE, DLST
Subjects: Q Science > QH Natural history
Q Science > QR Microbiology
Divisions: Faculty of Medicine, Health and Life Sciences > School of Medicine
Depositing User: آقای بهرام سوسنی غریب وند
Date Deposited: 21 Jan 2019 10:10
Last Modified: 21 Jan 2019 10:10
URI: http://eprints.ajums.ac.ir/id/eprint/20733

Actions (login required)

View Item View Item